日本系碩士班以日本文學、日本語學、日本語教育、日本文化為主要研究領域，並輔以筆譯、口譯之專業訓練課程，旨在培養以日語能力為基礎，具備人文社會等跨領域素養與專業知能之優秀人才。師資專長領域涵蓋日本社會、文化、思想、教育、語言、歷史、宗教、文學、台灣日治 時期等。
現階段日文系碩士班科目：
♦畢業學分：34學分（論文學分另計）
♦必修科目：論文(0)
♦選修科目：
| 文學領域 | ||
|---|---|---|
| 文學研究方法導論(2) | 村上春樹專題研究(2) | 品頭論足村上春樹(2) |
| 日治時期文學研究(2) | 明治大正文學導論(2) | 日本古典文學選讀(2) |
| 日本古典文學研究(2) | 日本文學與性別文化研究(2) | |
| 語學領域 | ||
|---|---|---|
| 社會語言學專題研究(2) | 日治時期語學研究(2) | 日本語言學研究(2) |
| 日本文章表現論(2) | 日語句法學導論(2) | 句法理論與日語研究方法(2) |
| 第二語言習得研究(2) | 日語談話分析(2) | 日語相互行為研究（一）（二）(2) |
| 語學研究方法導論(2) | 句法理論與日語研究方法(一)(二)(2) | |
| 文化領域 | ||
|---|---|---|
| 台日關係概論(2) | 日本文化研究方法論(2) | 12年國教第2外語日語課程模組開發(2) |
| 翻譯理論(2) | 日本近代化研究(2) | 日語專業與未來創客連結(2) |
| 翻譯技巧論(2) | 從東亞看日本(2) | 日本思想史研究（一）（二）(2) |
| 臺日交流文化論(2) | 12年國教之台日交流學習(2) | 日本近代化專書導讀(一)(二)(2) |
| 外語應用AI思維設計(一)(二)(2) | ||